Muzej ima stalne zbirke:
Zgodovina rečnega prometa: Litija je bila v zgodovini pomembna rečna postaja s čolnarskim uradom, mitnico in carinarnico. Prikazani so modeli plovil, ki so jih uporabljali na Savi in Ljubljanici, ter avtentično orodje za izdelovanje čolnov.
Zgodovina rudarstva: Zbirka se osredotoča predvsem na rudnik Sitarjevec, ki velja za enega najstarejših rudnikov pri nas in še danes za eno najbogatejših najdišč mineralov v Evropi. Tod so rudarili že v železni dobi, v času Avstro-Ogrske pa je veljal za drugi največji rudnik svinca v Evropi. Pomemben pečat je kraju pustila tudi Topilnica Litija, ki je obratovala od 2. polovice 19. stoletja do tridesetih let 20. stoletja.
Zgodovina železnice: Železnica je v zasavske kraje prinesla največji in najhitrejši razvoj v vsej zgodovini in Litija je prav zaradi nje na prelomu stoletja postala gospodarsko, upravno in kulturno središče, ki je cvetelo vse tja do začetka 2. svetovne vojne.